مقایسه خاموش کننده های فلورسنت و غیرفلورسنت روش real-time pcrدر پلات های آمپلیفیکیشن استاندارد ژن دلتا-۶ دساتوراز در کشت سلولی رده panc-۱

Authors

مهدی سهمانی

m. mehdi مسعود دارابی

m. darabi شیما بیاگوی

sh. biagowi رضا نجفی پور

r. najafipour تقی ناصرپورفریور

abstract

زمینه: استفاده از خاموش­کننده­های غیرفلورسنت در روش real-time pcr برای بررسی بیان ژن مناسب است.   هدف: مطالعه به منظور مقایسه توانایی دو نوع خاموش کننده فلورسنت و غیرفلورسنت با توجه به نتایج real-time pcr انجام شد.   مواد و روش­ها: این مطالعه تحلیلی در سال 1391 در آزمایشگاه رفرانس دانشگاه علوم پزشکی قزوین انجام شد. سلول­های سرطانی پانکراس انسان ( (panc-1 در فلاسک­های 75 سانتی­متری کشت و تکثیر شدند. سپس 106×3 سلول در پلیت­های 6 خانه­ای تحت تأثیر داروهای مؤثر بر سیگنال­های خاص درون سلولی قرار گرفتند و میزان تغییر بیان ژن دلتا-6 دساتوراز در شرایط یکسان، یک بار با خاموش­کننده فلورسنت و بار دیگر با خاموش­کننده غیرفلورسنت با روش real-time pcr بررسی شد. داده­ها با آزمون آماری تی و براساس روش δδct با فرض کارآیی 100 درصد تحلیل شدند.   یافته­ها: خاموش کننده­های فوق، با جذب متفاوت نشر گزارش­گر (reporter) ، باعث تفاوت در نتایج حاصل از real-time pcr شدند. پلات آمپلیفیکیشن هنگام استفاده از خاموش­کننده غیرفلورسنت، دقیق­تر و میزان خط پایه ( base line ) پایین­تر بود و به این ترتیب نسبت سیگنال به noise کاهش یافت. با استفاده از خاموش­کننده غیرفلورسنت، به دلیل افزایش دمای ذوب (tm) و کاهش اتصالات غیراختصاصی، میزان عددی دوره آستانه ( ct ) نیز کاهش یافت.   نتیجه­گیری: با توجه به یافته­ها، استفاده از خاموش­کننده غیرفلورسنت نسبت به فلورسنت مناسب­تر و جای­گزین بهتری برای خاموش کننده­های متداول، به خصوص در مطالعه­های تشخیصی آلل­ها و snp (single nucleotide polymorphism) بود .

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

مقایسه خاموش کننده های فلورسنت و غیرفلورسنت روش Real-time PCRدر پلات های آمپلیفیکیشن استاندارد ژن دلتا-6 دساتوراز در کشت سلولی رده PANC-1

  زمینه: استفاده از خاموش­کننده­های غیرفلورسنت در روش Real-time PCR برای بررسی بیان ژن مناسب است.   هدف: مطالعه به منظور مقایسه توانایی دو نوع خاموش کننده فلورسنت و غیرفلورسنت با توجه به نتایج Real-time PCR انجام شد.   مواد و روش­ها: این مطالعه تحلیلی در سال 1391 در آزمایشگاه رفرانس دانشگاه علوم پزشکی قزوین انجام شد. سلول­های سرطانی پانکراس انسان ( (PANC-1 در فلاسک­های 75 سانتی­متری کشت و تکثیر...

full text

بررسی اثرات عصاره هیدروالکلی جلبک Sargassum ciliforium بر رده سلولی سرطان کولون HT-29 و ارزیابی بیان ژن های P53 و APCبا روش Real time PCR

سرطان روده بزرگ سومین سرطان شایع در جهان است. با توجه به افزایش بروز سرطان استفاده از مولکول های جدید شیمی درمانی مورد نیاز می باشد. بسیاری از مطالعات و تحقیقات نشان داده است که سرطان روده می تواند از طریق محصولات دریایی طبیعی که دارای مقادیر بسیاری از مواد فعال بیولوژیکی با ساختارهای شیمیایی و فعالیت های دارویی جدید هستند درمان شود. هدف از این مطالعه بررسی اثرات عصاره هیدروالکلی جلبک Sargassum...

full text

بررسی بیان ژن های CCDC26 و C-Kit در رده های سلولی لوسمی لنفوبلاستیک حاد

Background and Aim: Acute Lymphoblastic Leukemia is the most common cancer in children and is one of the main causes of their mortality. In this study, we examined the expression of long noncoding RNA CCDC26 gene and its downstream C-Kit gene in acute lymphocytic Leukemia cell line. Materials and Methods: This is an experimental study. In this study, the acute Lymphoblastic Leukemia cell lines...

full text

بررسی سمیت سلولی نانوذره اکسید سریم (CeO2) روی رده سلولی سرطان کولون ( HT29 )و آنالیز بیان ژن های آپوپتوزی کاسپاز 3 و 9 با استفاده از روش Real Time PCR و فلوسیتومتری

هدف: هدف از مطالعه حاضر بررسی اثرات سمیت سلولی نانو ذره اکسید سریم روی رده سلولی سرطانی کلون HT29 و آنالیز بیان ژن‫های آپوپتوزیسی کاسپاز 3 و 9 می‫باشد. مواد و روش‫ها: در این مطالعه سلول‌های HT 29 در فواصل زمانی 24، 48 و 72 ساعت تحت تاثیر غلظت‌های  78/0، 56/1، 12/3، 25/6، 5/12، 25،50، 100 میلی‫گرم بر میلی‫لیتر از نانوذره اکسید سریم قرار گرفته و...

full text

شناسایی لیستریا مونوسیتوژنز از شیر خام به روش های کشت سلولی و PCR ژن actA

مواد غذایی از راه های مختلفی در معرض آلودگی میکروبی قرار می گیرد. یکی از باکتری های بیماری زا که از طریق مواد غذایی از جمله: شیر خام، سبزیجات به انسان منتقل می شود، باکتری لیستریا مونوسایتوژنز است که باعث بیماری های مختلفی از جمله: مننژیت، کنژونکتیویت، سپتی سمی و سقط جنین می باشد. با توجه به گزارشاتی که از آلودگی های شیر و فرآورده های آن به لیستریا مونوسایتوژنز داریم، به خصوص در کشورهای در حال ...

full text

مقایسه الگوی بیانی ژن های اصلی مسیر خود بازآفرینی در رده های سلول سرطانی، بافت سرطانی و بافت سالم تومور مثانه

زمینه و هدف: یکی از دلایل ایجاد سرطان، بیان نا به جای ژن های کنترل کننده مسیر خود بازآفرینی در سلول سرطانی است، لذا در این مطالعه بیان ژن های اصلی کنترل کننده مسیر خود بازآفرینی شامل OCT4، NANOG، KLF4، SOX2 و Nucleostemin در دو رده سلولی 5637 و HT1376، بافت سرطانی و بافت سالم نمونه های بیوپسی بافت سرطانی مثانه، مورد بررسی قرار گرفت. روش بررسی: در این مطالعه آزمایشگاهی، رده های سلولی در فلاسک ها...

full text

My Resources

Save resource for easier access later


Journal title:
مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی قزوین

جلد ۱۷، شماره ۵، صفحات ۱۷-۲۴

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023